Новости

May 06, 2023

Противовирусная передача сигналов с помощью протеазы CRISPR, активируемой циклическими нуклеотидами.

Природа том 614, стр.

Nature, том 614, страницы 168–174 (2023 г.) Процитировать эту статью

10 тысяч доступов

1 Цитаты

167 Альтметрика

Подробности о метриках

Защитные системы CRISPR, такие как хорошо известные системы Cas9, нацеленные на ДНК, и системы типа III, нацеленные на РНК, широко распространены у прокариот1,2. Последний организует сложный противовирусный ответ, который инициируется посредством синтеза циклических олигоаденилатов после узнавания чужеродной РНК3,4,5. Среди большого набора белков, которые связаны с системами типа III и, по прогнозам, связывают циклические олигоаденилаты6,7, нам выделилась CRISPR-ассоциированная Lon-протеаза (CalpL). CalpL содержит сенсорный домен семейства SAVED7, слитый с эффекторным доменом протеазы Lon. Однако механизм действия этого эффектора неизвестен. Здесь мы сообщаем о структуре и функции CalpL и показываем, что этот растворимый белок образует стабильный трехчастный комплекс с двумя другими белками, CalpT и CalpS, которые кодируются тем же опероном. После активации циклическим тетрааденилатом (cA4) CalpL олигомеризуется и специфически расщепляет гомолог MazF CalpT, что высвобождает из комплекса экстрацитоплазматический функциональный σ-фактор CalpS. Наши данные обеспечивают прямую связь между обнаружением чужеродных нуклеиновых кислот с помощью CRISPR и регуляцией транскрипции. Кроме того, наличие домена SAVED, который связывает циклический тетрааденилат в эффекторе CRISPR, указывает на связь с антифаговой сигнальной системой на основе циклических олигонуклеотидов.

Это предварительный просмотр контента подписки, доступ через ваше учреждение.

Доступ к журналу Nature и 54 другим журналам Nature Portfolio.

Приобретите Nature+, нашу выгодную подписку с онлайн-доступом.

29,99 долларов США / 30 дней

отменить в любое время

Подпишитесь на этот журнал

Получите 51 печатный выпуск и онлайн-доступ.

199,00 долларов США в год

всего $3,90 за выпуск

Возьмите напрокат или купите эту статью

Получите только эту статью до тех пор, пока она вам нужна

$39,95

Цены могут зависеть от местных налогов, которые рассчитываются во время оформления заказа.

Кристаллические структуры были депонированы в базе данных Protein Data Bank под кодами доступа 7QDA, 8B0R и 8B0U. Данные и модели SAXS были депонированы в Банк биологических данных малоуглового рассеяния под кодами доступа SASDQM4, SASDQN4, SASDQP4 и SASDQQ4. В этом исследовании использовались следующие записи банка данных белков: 2H27, 3K1J, 4ME7, 4IZJ, 4LUP, 5ZX2, 5CR2, 6VM6, 6SCE и 7RWK. Исходные данные приведены в статье.

В этой работе не использовался специальный код.

Макарова К.С., Вольф Ю.И., Кунин Е.В. Классификация и номенклатура систем CRISPR–Cas: откуда отсюда. CRISPR J. 1, 325–336 (2018).

Статья в Академии Google

Чжу Ю., Кломпе С.Э., Влот М., ван дер Ост Дж. и Стаалс Р.Х.Дж. Стрельба по посланникам: системы CRISPR–Cas, нацеленные на РНК. Биология. Представитель 38, БСР20170788 (2018).

Статья в Академии CAS Google

Казлаускене М., Костюк Г., Венцловас Ч., Тамулайтис Г. и Сикснис В. Сигнальный путь циклических олигонуклеотидов в системах CRISPR-Cas типа III. Наука 357, 605–609 (2017).

Статья CAS ADS Google Scholar

Нивонер О. и др. Системы CRISPR-Cas типа III продуцируют циклические олигоаденилатные вторичные мессенджеры. Природа 548, 543–548 (2017).

Статья CAS ADS Google Scholar

Руйон К., Атукораладж Дж. С., Грэм С., Грюшоу С. и Уайт М. Ф. Контроль синтеза циклических олигоаденилатов в системе CRISPR типа III. eLife 7, e36734 (2018).

Статья в Академии Google

Шмаков С.А., Макарова К.С., Вольф Ю.И., Северинов К.В., Кунин Е.В. Систематическое предсказание генов, функционально связанных с системами CRISPR-Cas, путем анализа соседства генов. Учеб. Натл Акад. наук. США 115, E5307–E5316 (2018).