Блог

May 15, 2023

Ansa Biotechnologies объявляет об успешном синтезе de novo самого длинного в мире олигонуклеотида длиной 1005 оснований

- Следующим рубежом в синтезе олигонуклеотидов является прямой синтез

- Следующим рубежом в синтезе олигонуклеотидов является прямой синтез последовательностей генной длины.

- Компания Ansa синтезировала олигонуклеотид длиной 1005 оснований с высочайшей в отрасли точностью.

- В апреле 2023 года Ansa запустит программу раннего доступа к клональным синтетическим генам, чтобы помочь исследователям получить последовательности, которые было трудно синтезировать.

ЭМЕРИВИЛЛ, Калифорния, 9 марта 2023 г. – (BUSINESS WIRE) – Компания Ansa Biotechnologies, Inc., пионер синтеза ДНК нового поколения, сегодня объявила об успешном синтезе de novo самого длинного в мире олигонуклеотида ДНК, когда-либо полученного. в одном синтезе.

Последовательность из 1005 оснований кодирует ключевую часть вектора AAV, используемого для разработки генной терапии, и содержит сложные особенности, включая сильные вторичные структуры и высокое содержание GC, которые чрезвычайно сложно синтезировать с использованием традиционных методов, требующих сборки более коротких олигонуклеотидов. Олигонуклеотид «Ansamer™» был клонирован с использованием стандартных методов молекулярной биологии, и было обнаружено, что он содержит примерно 28% молекул с идеальной последовательностью, что указывает на лучший в отрасли средний пошаговый выход примерно 99,9% во время его синтеза.

С момента появления первого метода химического синтеза олигонуклеотидов более 60 лет назад улучшение длины и качества синтезируемых олигонуклеотидов открыло новые возможности применения, которые изменили наши отношения с миром природы. Возможность синтезировать 20-30 основных молекул позволила разработать ПЦР и секвенирование ДНК, что заложило основы технологии рекомбинантной ДНК и молекулярной диагностики. Синтез молекул из 50–100 оснований позволил использовать новые методы точного манипулирования ДНК, включая сайт-направленный мутагенез и генную инженерию. Сегодня высокопроизводительный синтез олигонуклеотидов длиной до 350 оснований позволяет проводить полногеномные эксперименты CRISPR и использовать новые методы белковой инженерии. Однако текущий золотой стандарт синтеза олигонуклеотидов, нуклеозид-фосфорамидитный метод, достиг плато в длине и качестве олигонуклеотидов, которые он может производить из-за внутренних ограничений.

Следующим рубежом в синтезе олигонуклеотидов является прямой синтез последовательностей генной длины. «Синтез 1005-мера представляет собой важную веху в этой области и превосходит то, что многие считали возможным», — сказал Дэниел Лин-Арлоу, доктор философии, генеральный директор и соучредитель Ansa Biotechnologies. «Наши чрезвычайно длинные олигонуклеотиды Ansamer позволят нам производить генетические конструкции для исследователей гораздо быстрее, надежнее и с меньшими ограничениями последовательности, чем это возможно в настоящее время».

У ученых растет спрос на синтетическую ДНК длиной до гена для таких применений, как клеточная и генная терапия, белковая инженерия, биопроизводство и фундаментальные исследования в области наук о жизни. Более длинные последовательности в настоящее время создаются путем «сшивания» более коротких олигонуклеотидов, но этот процесс не работает с последовательностями, которые содержат определенные особенности, такие как вторичные структуры, повторы и высокое или низкое содержание GC. Однако эти особенности часто необходимы для функционирования ДНК. Подход Ансы преодолевает проблемы, связанные со сборкой этих типов последовательностей из более коротких олигонуклеотидов, за счет прямого синтеза их в виде одного сверхдлинного олигонуклеотида.

Запатентованная технология ферментативного синтеза олигонуклеотидов Ansa основана на запатентованных реагентах полимеразно-нуклеотидного конъюгата, которые могут быстро удлинять молекулу ДНК на одно основание за раз. Конъюгаты, которые содержат независимую от матрицы полимеразу, связанную с одним нуклеотидом через линкер, предлагают значительные преимущества с точки зрения скорости и гибкости по сравнению с другими подходами ферментативного синтеза, основанными на свободных нуклеотидах. Кроме того, Ansa разрабатывает серию мультиплексированных специализированных инструментов и информационных систем, адаптированных для конкретных производственных возможностей и последующих приложений.