Bruker представляет ультрамасс-спектрометр timsTOF с преобразовательной чувствительностью, PASEF MS/MS 300 Гц и VistaScan™ для увеличения диаметра

Блог

ДомДом / Блог / Bruker представляет ультрамасс-спектрометр timsTOF с преобразовательной чувствительностью, PASEF MS/MS 300 Гц и VistaScan™ для увеличения диаметра

Jul 11, 2023

Bruker представляет ультрамасс-спектрометр timsTOF с преобразовательной чувствительностью, PASEF MS/MS 300 Гц и VistaScan™ для увеличения диаметра

Опубликовано: 5 июня 2023 г. timsTOF Ultra Дальнейшие достижения

Опубликовано: 5 июня 2023 г.

timsTOF Ultra — дальнейшее развитие количественной пространственной и одноклеточной 4D-протеомики и 4D-липидомики™, иммунопептидомики, анализа PTM и белок-белковых взаимодействий — со скоростью и надежностью

ХЬЮСТОН – (BUSINESS WIRE) – На 71-м заседании ASMS корпорация Bruker (Nasdaq: BRKR) объявила о преобразовательной чувствительности платформы 4D-протеомики timsTOF, выпустив новый масс-спектрометр timsTOF Ultra. Он включает в себя новый источник ультра-ионов Captive Spray Ionization (CSI) с увеличенным капилляром и оптимизированным вихревым потоком газа, новую XR-ячейку TIMS 4-го поколения (разделение подвижности захваченных ионов) и 14-битный дигитайзер. TimsTOF Ultra может идентифицировать более 55 тысяч пептидов, которые картируются в 5000 белковых групп на одноклеточном уровне с нагрузкой белка 0,125 нг, при 1% FDR, и более 4800 белковых групп, количественно определяемых при CV <20%. Эта революционная чувствительность и производительность количественного анализа ниже уровня белковой нагрузки в 1 нг устанавливают новый стандарт. Непревзойденная чувствительность в сочетании с проверенной надежностью платформы timsTOF и рабочим циклом PASEF теперь до 300 Гц для МС/МС обеспечивает значительное дальнейшее улучшение производительности для сверхмалых объемов образцов, включая объективную протеомику отдельных клеток и липидомику отдельных клеток. , объективная пространственная протеомика, иммунопептидомика, фосфопротеомика, анализ PTM и исследования белок-белкового взаимодействия (PPI).

Этот пресс-релиз содержит мультимедийные материалы. Полный выпуск можно посмотреть здесь: https://www.businesswire.com/news/home/20230605005326/en/

Масс-спектрометр timsTOF Ultra (Фото: Business Wire)

Доктор Фабиан Кошиа, руководитель группы пространственной протеомики в Центре Макса Дельбрюка в Берлине, Германия, сказал: «Рабочий процесс Dia-PASEF с чувствительностью отдельных клеток на timsTOF Ultra вывел наши исследования протеомики тканей с низкими затратами на новый уровень. Используя 20-минутный градиент ЖХ с нанопотоком в сочетании с оптимизированным методом Dia-PASEF (окна 3x8) Bruker, мы теперь можем воспроизводимо количественно определять 1500–2000 белков из микрорассеченной лазером ткани FFPE печени мыши площадью всего 1500 мкм2, области, соответствующие приблизительно 1-2000 белков. 2 гепатоцита».

Эти достижения timsTOF Ultra были достигнуты без ущерба для превосходной надежности высокопроизводительной протеомики, например, при 50 образцах в день (SPD) или даже до 398 SPD, а также высочайшей достоверности идентификации <1% пептидов и <1% белковые FDR (частота ложных открытий), позволяющие избежать перекрестной реактивности, наблюдаемой при использовании методов таргетного иммунного распознавания.

Профессор доктор Карл Мехтлер, руководитель протеомики Инновационного центра Научно-исследовательского института молекулярной патологии (IMP), Института Грегора Менделя (GMI) и Института молекулярной биотехнологии Австрийской академии наук (IMBA), добавил: «Чтобы Чтобы по-настоящему понять клеточные механизмы и заболевания, крайне важно различать различные типы клеток. для обнаружения 6000 или более белков в одноклеточном эксперименте. timsTOF Ultra преодолел эти барьеры, позволяя нам исследовать протеом отдельных клеток со скоростью и беспрецедентной чувствительностью. Благодаря timsTOF Ultra анализ отдельных клеток достиг новых высот , и я очень рад видеть, куда этот прорыв приведет нас дальше».

Bruker также представляет программное обеспечение VistaScan для синхронизации линейного изменения TIMS с квадрупольным сканированием, чтобы получить дополнительную выгоду от информации о подвижности ионов в масштабе. Этот сложный динамический связанный пандус поддерживает новый режим Midia-PASEF, представленный Стефаном Тензером (doi.org/10.1101/2023.01.30.526204).

Доктор Стефан Тенцер, профессор количественной протеомики и руководитель основного центра MS Университета Йоханнеса Гутенберга в Майнце, прокомментировал: «Наша лаборатория фокусируется на методах количественной протеомики, которые требуют высочайшей чувствительности и высочайшего извлечения информации. Вместе с Bruker мы разработали новый метод количественной протеомики. максимальный диаметр информации (midia) Режим сбора данных сканирования PASEF, который обеспечивает чувствительность независимого от данных сбора (dia) и одновременного преобразования данных в спектры, подобные зависимому от данных сбору (dda).Потенциал Midia-PASEF для иммунопептидомики и фосфопротеомики особенно интересен. "